Fruits Omics Database について

　Fruits Omics Databaseは、生研センターイノベーション創出基礎的研究推進事業 平成21年度採択課題「大果果実の作出に向けたバラ科果樹枝変わり大果変異の機構解明」の研究成果を基に、セイヨウナシ、ニホンナシ、リンゴ、オウトウといったバラ科果樹の果肉の、年間を通したトランスクリプトーム、プロテオーム、メタボロームデータをまとめたオミクスデータベースです。データの生物学的意義を解釈しやすくするため、PCAや代謝マップに使用できる形で加工したデータも提供しており、各種解析も行いやすくなっています。なお、このデータベースは、全て無料で利用できます。

References

Shiratake, K. and Suzuki, M. (2016) Omics studies of citrus, grape and rosaceae fruit trees. Breed. Sci. 66: 122-138. Reuscher S., Fukao Y., Morimoto R., Otagaki S., Oikawa A., Isuzugawa K. and Shiratake K. (2016) Quantitative proteomics based reconstruction and identification of mtabolic pthways and membrane transport proteins related to sugar accumulation in feveloping fruits of pear (Pyrus Communis). Plant Cell Physiol. 57: 505-518.

Oikawa A1, Otsuka T, Jikumaru Y, Yamaguchi S, Matsuda F, Nakabayashi R, Takashina T, Isuzugawa K, Saito K, Shiratake K (2011.Dec) J Sep Sci. 34(24):3561-7.

Kenji Nashima, Hirokazu Takahashi, Mikio Nakazono, Tokurou Shimizu, Chikako Nishitani, Toshiya Yamamoto, Akihiro Itai, Kanji Isuzugawa, Toshio Hanada, Tadashi Takashina, Mari Kato, Shogo Matsumoto, Akira Oikawa, Katsuhiro Shiratake (2013) J. Japan. Soc. Hort. Sci 82: 301-311.

Kenji Nashima, Tokurou Shimizu, Chikako Nishitani, Toshiya Yamamoto, Hirokazu Takahashi, Mikio Nakazono, Akihiro Itai, Kanji Isuzugawa, Toshio Hanada, Tadashi Takashina, Shogo Matsumoto, Shungo Otagaki, Akira Oikawa, Katsuhiro Shiratake (2013) Scientia Horticulturae 164: 466-473.

J. Hortic. Sci. Biotech. 2014 89: 293-300.

Stefan Reuscher, Kanji Isuzugawa, Miki Kawachi, Akira Oikawa, Katsuhiro Shiratake (2014) Scientia Horticulturae 176: 255-260.

Akira Oikawa, Takao Otsuka, Ryo Nakabayashi, Yusuke Jikumaru, Kanji Isuzugawa, Hideki Murayama, Kazuki Saito, Katsuhiro Shiratake (2015.10) PLoS one (7): e0131408.